Small RNA 是一類重要的體內調節分子，長度在 18-30nt，主要包括 miRNA、 siRNA 和 piRNA。在基因表達調控、生物個體發育、代謝及疾病的發生等生理過程中起著重要的作用。Small RNA 測序采用 Illumina 測序平臺，研究某一物種特定組織在特定狀態下的已知 Small RNA，也可發現新的物種或組織特異Small RNA并預測其靶基因，為研究 Small RNA 的功能及此物種的基因調控機制提供了有力工具，已廣泛應用于動植物的研究和醫學領域。

技術路線

技術路線

分析內容

    1.     數據質控與統計
    2.     miRNA預測
    3.     miRNA 靶基因預測
    4.     miRNA表達分析
          4.1     不同樣品表達量對比
          4.2     樣本相關性分析
          4.3     樣品主成分分析 		    5.     miRNA 差異表達分析
          5.1     miRNA 差異表達分析
          5.2     差異 miRNA 火山圖
          5.3     差異 miRNA 表達 M-A 圖
          5.4     差異 miRNA 聚類熱圖
    6.     差異表達 miRNA 靶基因的 GO 和 KEGG 富集分析
          6.1     差異表達 miRNA 靶基因 GO 富集分析
          6.2     差異表達 miRNA 靶基因 KEGG 富集分析

部分分析結果展示

RPM分布圖

KEGG Pathway富集條形圖

案例解析

組織中miRNA在巴雷特食管非內窺鏡診斷中的選擇與應用
本研究分析了38例Barrett’s esophagus（BE）和26例正常食管患者內鏡時采集的2組獨立食管活檢組織的miRNA的表達譜，確定了一種可以識別BE患者細胞海綿樣本的圖譜，AUC為0.93.此外mir-194通過表現遺傳在BE樣品中表達增加，推測這可能與BE的發病機制有關。

Mir192/194和miRNA啟動子區域低甲基化形成mir192-194-2共表達簇

Mir192/194和miRNA啟動子區域低甲基化形成mir192-194-2共表達簇


參考文獻：
Li X, Kleeman S, et al. Selection and Application of Tissue microRNAs for Nonendoscopic Diagnosis of Barrett’s Esophagus. Gastroenterology, 2018.

訂購與咨詢

您可以通過以下任意方式下單或咨詢，工作時間我們保證在1小時內給您反饋：

  1. Email：將您的需求填寫完整后發送到support@synbio-tech.com
  2. 電話訂購：您可以直接撥打免費熱線4000-973-630（按1）聯系我們經驗豐富的工程師
  3. 在線咨詢：您有任何技術問題均可與我們進行網頁在線互動