Syno?人類全基因組CRISPR敲除文庫(Human Genome CRISPR Knockout Libraries)
CRISPR技術作為繼ZFN和TALEN之后第三代基因編輯技術，具有高效、快速、精準等特點，廣泛應用于基因功能研究、藥物開發、作物育種、分子診斷、精準醫療等領域。利用CRISPR 文庫進行基因組功能篩選一直是當下熱門的研究手段，被全球知名期刊爭相報道。
CRISPR文庫雖然是進行科學研究的強大工具，但是由于其后期篩選工作量大、成本消耗高，也成為了其普遍應用的阻礙。泓迅科技專注于CRISPR基因編輯技術的研究工作，不斷提升服務和產品的供應能力，在定制化CRISPR文庫構建的基礎上，推出Syno?人類全基因組CRISPR敲除文庫，領先的設計和規范化的文庫構建實現高質量交付，降低客戶的研究成本，縮短產品交付周期。
Syno?人類全基因組CRISPR敲除文庫根據Genome CRISPR數據庫中記錄的以前發表的CRISPR篩選中的表型以高靶向活性和低脫靶效率為準則，結合多種不同的設計原則，選擇評分較高的sgRNA序列。根據近期發表的評分規則，Syno? CRISPR文庫的評分要優于GeCKOv2文庫和隨機挑選的已發表sgRNA樣本。
Syno? 人類全基因組CRISPR敲除文庫由三個獨立子庫A、B、C組成，A和B文庫分別針對18,913和18,334個蛋白質編碼基因。子庫A包含根據設計標準排名最好的sgRNA，在較低的文庫覆蓋率下實現高質量的篩選。子庫B包含第二層sgRNA，當需要更高的sgRNA覆蓋率時，可以用來補充子庫A。子庫C是通過整合大規模CRISPR篩選的標準化資源，以及多個效率指標，對廣泛采用的CRISPR文庫中的300,000多個特有的sgRNA進行評估和排序，設計出了一個優化的人類最小全基因組敲除文庫，針對18,761個基因，每個基因設計2個優化的sgRNA，合計有37,522個基因靶向和200個非靶向sgRNA。子庫C的大小比目前公開的人類全基因組CRISPR文庫均小。雖然子庫C較小但是并不影響對必須基因的識別，多用于復雜條件下癌癥細胞模型的CRISPR篩選。
文庫產品優勢
- 精準的sgRNA設計：利用有效的sgRNA設計模型結合深度學習算法，設計出具有高靶向活性和低脫靶率的sgRNA序列。
- 優化的載體：采用lentiCRISPRv2載體，具備Puro藥篩功能，可進行慢病毒包裝，提高轉染效率。
-
節約成本：高編輯效率CRISPR文庫，減輕后期篩選工作的難度，降低研究成本。
-
一站式服務：提供NGS驗證、病毒包裝、生信分析等定制化的服務。
- 嚴格質控：構建的文庫覆蓋率>99.9%，均一性<10。
- 交付周期短：質粒文庫次日發貨。
文庫產品詳情
| 產品編號 | 產品名稱 | 序列信息 | 載體信息 | 價格（元） | 規格 |
|---|---|---|---|---|---|
| STCRI211101 | Syno?人類全基因組CRISPR敲除文庫(Human Genome CRISPR Knockout Libraries) | 子庫A： 靶向18,913個基因，設計74,552個sgRNA序列和435個對照（非靶向）sgRNA序列，合計74,987個sgRNA序列。 |
pLentiCRISPR v2-Puro （單質粒系統）  pLentiGuide-Puro(雙質粒系統) pLentiGuide-Puro-GFP(雙質粒系統) |
咨詢 | 200μg |
| STCRI211102 | 子庫B： 靶向18,334個基因，設計71,048個sgRNA序列和435個對照（非靶向）sgRNA序列，合計71,483個sgRNA序列。 |
pLentiCRISPR v2-Puro （單質粒系統） pLentiGuide-Puro(雙質粒系統) pLentiGuide-Puro-GFP(雙質粒系統) |
咨詢 | 200μg | |
| STCRI211103 | 子庫C： 靶向18,761個基因，設計37,522個sgRNA序列和200個對照（非靶向）sgRNA序列，合計37,722個sgRNA序列。 |
pLentiCRISPR v2-Puro （單質粒系統） pLentiGuide-Puro(雙質粒系統) pLentiGuide-Puro-GFP(雙質粒系統) |
咨詢 | 200μg | |
| STCRI100052 | Syno?小鼠全基因組CRISPR敲除文庫(Mouse Genome CRISPR Knockout Library) |
靶向20,611個基因和1,175個miRNA 3個sgRNA/基因。 |
pLentiCRISPR v2-Puro （單質粒系統） |
咨詢 | 200μg |
| STCRI113345 | Syno?人類膜蛋白CRISPR激活文庫(Human Membrane Protein CRISPR Activation Library) | 靶向6,213個基因的啟動子，設計58,071個sgRNA序列和500個對照（非靶向）sgRNA序列，合計58,571個sgRNA序列。 | pKVL2-U6gRNA_ SAM(BbsI)-PGKpuroBFP-W |
咨詢 | 200μg |
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相關服務
sgRNA定制化設計
sgRNA文庫構建
ssDNA合成
微生物基因組編輯
哺乳動物基因組編輯
sgRNA生物信息分析
參考資料
[1] Luisa Henkel, Benedikt Rauscher, Barbara Schmitt, et al. Genome-scale CRISPR screening at high sensitivity with an empirically designed sgRNA library. BMC Biol. 2020; 18: 174.
[2]Emanuel Gon?alves, Mark Thomas, Fiona M. Behan, et al. Minimal genome-wide human CRISPR-Cas9 library. Genome Biol. 2021; 22: 40.
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